2008年，内河职能调整后，市内河处以市政府提出的“一年有变化，三年有大变化，五年有根本性变化”的目标，积极开展了城区内河三年整治。
内河整治工作以水质改善为中心，优先确保“河畅、水清”，整治内容因河制宜，着重考虑清淤、截污及护岸；根据流域治理的理念，以流域为单元，区域推进内河整治；加强河网水系瓶颈沟通，加大城中村及旧村河道整治力度；开展科技治河新技术、新工艺的探索，治理河道水质黑臭和富营养化污染问题。
2002年至2012年10年间，我市合计整治河道155公里，新建河岸护坡约39公里，清除河道底泥约329万立方米，新增绿化面积约26公顷，截流沿河排污口677处。
经整治，城区内河沿河排污口和河床底泥大量减少，河道蓄水量与排涝能力全面提高，内河水质明显改善，水体黑臭现象基本杜绝，城区内河景观形象得到了有效提升。通过对整治前后河道的水质检测发现，水体中总磷下降了40%，耗氧量降低了约18%，总氮下降了21%，部分指标已经达到Ⅳ类水体标准。
近年来，市内河处还将沿河开发与保护、建设与管理结合起来，通过种植水生植物、开展垂直绿化、实施灯光亮化、改建沿河绿化、新建市民公园等形式，对位于城市核心区、景观要求高的北斗河、护城河、新河、柳西河、前塘河等主要河道实施了内河景观建设工程，打造沿河市民公园，为附近居民提供了优美的休闲场所，累计新增绿化面积约26公顷，种植水体绿化6.5公顷。
链接：位于江东区常青藤小区内的明一河从小区中间穿过，清澈的河水及两岸优美的环境给小区注入了一股活力。闲暇时，居民常常漫步小区沿河步道，尽情享受着潺潺河水给生活带来的舒适和安逸。
然而，回顾10年前，这条河曾是小区居民心中的一个痛处。由于城中村改造滞后，沿河市政管网的不完善等原因，附近菜场及旧村的污水直排入河，造成了严重的污染。加上河网水系流动性差，河床淤积严重，水体自净能力弱，使得明一河成为了一条不折不扣的臭水河。每到夏季，河水发黑发臭，阵阵恶臭使得附近的居民即使紧闭门窗仍难以忍受。多年来，反映明一河黑臭的信访件一直是内河信访工作的焦点，仅2007年7月，就有10余位市民投诉明一河黑臭问题。
为解决这一难题，市城管局内河处先后对明一河及周边的长塘河、吉庆河、牛郎河实施了截污工程，使得污水入河的现象得到了一定的缓减。2010年，随着我市新一轮内河整治工程的全面推进，市、区内河管理部门对明一河及周边的直落河、牛郎河等河道进行了治理。通过截污纳管、河道清淤等传统治理方法，有效缓减了污水入河、河床淤积等问题；同时通过推流曝气等生态治理手段的应用，进一步改善了河道水质，提高了水体自净能力，完善了生态修复功能。