在本拉丹死亡地巴基斯坦阿伯塔巴德，不少居民不相信他已死亡。
居民哈里斯拉希德说：“怎么会没有人知道他在这里？他们为什么那么快举行葬礼？都是假的，是一场戏。”
现年25岁的当地居民卡迈勒汗说，美国的说法“可疑”。
质疑三 水刑逼出拉丹情报？
“基地”前3号人物确实遭受183次水刑，但拉丹的藏身地信息是停刑一年后提供的
美国国土安全研究人员2日说，一名帮助中央情报局找到本拉丹藏身处的“基地”组织成员多次遭受酷刑。刑讯拷问这一争议话题再次成为媒体关注焦点。
美国国土安全官员说，中情局从“基地”前3号人物哈立德口中得知与本拉丹一名“信使”相关的情报，最终顺藤摸瓜找到本拉丹藏身处。哈立德是“911”恐怖袭击主谋之一，2003年3月在巴基斯坦落网。一名美国政府官员透露，哈立德遭水刑183次。
水刑指审讯人员用布或纸张盖住审讯对象脸部并向上浇水，或把审讯对象头部浸入水中，模拟溺水时的窒息感觉。一名前美国国土安全官员说，中情局2003年停止使用水刑等严酷手段审问哈立德，但这名恐怖嫌疑人2004年才向中情局“交待”与本拉丹信使相关的第一份重要情报。这名官员说，中情局停止酷刑拷问3年后，哈立德开始与中情局广泛对话。其间，他承认认识一名代号为“科威特”的信使，使中情局把“科威特”锁定为重要目标并着手追踪，最终找到本拉丹。
质疑四 巴基斯坦庇护拉丹？
扎尔达里：于公，恐怖分子导致3万多巴基斯坦人丧生；于私，他们谋杀了我的妻子
巴基斯坦总统扎尔达里2日否认巴基斯坦暗中庇护本拉丹。他说，巴基斯坦是恐怖主义受害者之一，不会成为宗教极端组织发展的温床；巴方没有参加击毙本拉丹的军事行动，但向美方提供情报。
“反恐战争既属于美国，也属于巴基斯坦，”扎尔达里说，“坦白地说，巴基斯坦已为反恐立场付出巨大代价，巴基斯坦丧生的士兵多于北大西洋公约组织所有伤亡人员。我们已失去2000名警察、3万名无辜平民以及一代人的社会进步。”“就我而言，对本拉丹绳之以法不仅关乎政治，还涉及个人因素。那些恐怖分子谋杀了我们伟大的领导人，我孩子的母亲。”
扎尔达里的妻子、巴基斯坦首名女总理贝布托2007年12月遭自杀炸弹袭击身亡。她在生前自传中指认“基地”成员企图暗杀她，包括本拉丹之子哈姆扎本拉丹。
中国外交部发言人姜瑜3日就“基地”组织领导人本拉丹在巴基斯坦被击毙事答问时表示，巴基斯坦为国际反恐斗争作出了重要贡献，中方会继续坚定支持巴方根据自身国情制定和实施反恐战略。