旅游巴士中枪位置示意图。图片来源：香港文汇报
马尼拉人质挟持事件造成8名香港游客惨死，菲律宾警方在未深入调查前已宣称，在旅游巴内发现的58个弹壳全来自枪手步枪，并一口咬定8名死者均命丧枪手枪下。不过，据菲律宾传媒指，旅游巴上最少有20个弹孔是菲警开火留下的，其中有5发子弹更击中车内乘客座位椅背靠头部位置。香港特区保安局局长李少光指，香港警方已初步完成在肇事旅游巴的搜证、化验涉事枪械等的重要工作，待调查完成时，特区政府一定会跟进责任问题，还死伤者和他们的家人一个公道。
据香港文汇报报道，菲律宾ABS-CBN电视台昨日引述调查人员文件称，旅游巴两边车头灯各中1枪，挡风玻璃10多个弹孔中，右上方的1个弹孔是由菲律宾警方特种部队（SWAT）子弹射入；左边车头灯对上有3个弹孔，2发子弹由司机位旁边的窗射入；两边的车身和乘客位旁边的车窗有4个弹孔，菲警又射中右边前方车轮。
枪手门多萨在车门位置被射杀，该处亦留下最多SWAT开枪痕迹，1个在车门角对上，车门玻璃和旁边车身有6个弹孔。
菲警的子弹亦射入旅游巴车厢内，击中多个位置：1枪射中司机位车顶，乘客位旁边窗框亦被打中，最少有5发子弹射中部分乘客座位的头部椅背，左边后排车厢也有弹孔。
据称，菲律宾当局仍在调查人质死伤者有否被SWAT开火击中。
当晚有份参与攻击行动的警员和特警部队队员，已经交出他们的枪械，进行科学鉴证和弹道测试。
菲警方调查缺乏透明度，并多番留难到马尼拉参与调查的香港警方人员的举动备受各界批评。李少光昨日在香港立法会特别会议上表示，香港警方一直有调派警务人员，透过国际警务的合作方式，在马尼拉进行搜证和调查，并获菲律宾政府确认，会尽力提供协助，让香港警方的独立调查可以顺利进行。现时，警方已初步完成在肇事旅游巴的搜证、化验涉事枪械等的重要工作。警方会尽快将调查所得及验尸报告提交死因裁判官，让死因裁判官早日决定是否召开死因研讯。
李少光又说，特区行政长官曾荫权已经在8月26日正式去函菲总统亚基诺三世，重申严正要求菲律宾政府必须就事件进行全面、专业的调查，而报告要交代事件的发生经过，包括警方的行动详情及背后的考虑；菲律宾当局与枪手谈判的详细过程，特别是为何未能答应枪手要求，来换取人质安全释放；及每位死伤者致命、受伤的成因；菲律宾总统及司法部等，已多次公开承诺，会对事件进行全面、公正、完整的调查，不容任何隐瞒和偏袒，“我们期望菲律宾当局，以实际行动和日后公开的调查报告，兑现他们这个承诺”。