2009年，党中央、国务院领导强调，在复杂多变的国内外经济形势下，生态环境保护不能有一丝一毫放松。要把应对国际金融危机作为转变经济发展方式的重要机遇，把加强环境保护作为调整经济结构的重要举措，把生态建设作为培育新的经济增长点的重要内容。各部门、各地区认真贯彻党中央、国务院的重大部署，以做好国际金融危机形势下的环境保护工作为主线，以解决危害人民群众健康的突出问题为重点，积极探索中国生态环境保护的新道路。一年来，污染减排取得明显成效，污染防治稳步推进，基础能力建设取得积极进展，较好完成了各项工作任务。
一、重点流域污染防治工作取得新进展。认真贯彻胡锦涛总书记“让江河湖泊休养生息”的重要批示精神，召开全国环境保护部际联席会议暨松花江、淮河及黄河中上游流域水污染防治专题会议，创新落实政策举措。出台了《重点流域水污染防治专项规划实施情况考核暂行办法》，并全面建立了重点流域省界断面水质考核制度。考核评估2008年度规划实施情况结果显示，水质断面7成达标，淮河、海河、辽河、巢湖、滇池、松花江、三峡库区及其上游、黄河中游8个流域完成污染治理投资714.9亿元，建成项目1270个，在建项目785个。水专项全面实施，启动项目32个，课题230个，大部分示范工程和配套工程进入实施阶段。完成九大湖库生态安全评估，获取数据82万个，为制定“一湖一策”综合治理方案创造了条件。首次明确4000多个城镇集中式饮用水水源环境管理对象，城镇集中式饮用水水源地环境调查进展顺利。组织开展上海世博会和广州亚运会空气质量保障情况调研，全面部署长三角、珠三角区域联防联控工作。这些举措为降低重点流域地区的污染负荷发挥了重要作用。
二、着力解决关系民生的突出环境问题。2009年，陕西凤翔、湖南武冈、云南东川等地先后发生了12起重金属、类金属污染事件。相关部门和地方及时组织专家赶赴现场，开展环境应急监测，确认污染程度和范围，进行事故调查和处置，救治受害群众，责令关闭、停产污染企业，督促追究政府部门和企业负责人的责任，维护了社会稳定。
三、农村环境保护工作广泛开展。“以奖促治”是环境保护的一项重大政策创新。2009年，中央财政投资农村环境专项资金10亿元，支持1460多个城镇开展环境综合整治和生态建设示范试点，900多万名群众直接受益，带动各地农村环境保护投资近15亿元。这一政策解决了一批人民群众反映强烈的突出环境问题，使许多村庄的村容村貌明显改善。生态保护工作积极推进，全国土壤污染状况调查完成了30个省市（自治区）数据接受入库和初步审核工作，生态建设示范区工作进一步深化，生态文明建设试点有序进行。经国务院批准新增国家级自然保护区16处。
四、环境保护能力建设进一步加强。2007年以来，累积安排污染减排统计监测考核“三大体系”建设资金60.6亿元，新建、改造、接入自动站（点）787个，配备监测执法设备110501台（套），配备交通工具（车、船、艇）6114辆（艘），配备信息设备31668台（套）。建成污染源监控中心306个，对1.2万多家企业实施自动监控。去年，在应对国际金融危机的形势下，中央环保专项、农村环保专项、污染减排专项、中央预算内基建投资等能力建设和环境治理投入达到50亿元左右。国家环境信息与统计能力建设项目全面启动实施，以往“废气靠闻、废水靠看、噪声靠听”的局面大为改观。
五、环境保护政策法规体系不断健全。一是制定并实施有利于生态环境保护的经济政策。国家财政部、环保部和税务总局联合完成了开征环境税报告，组织制定并向经济综合部门提供290余种“高污染、高环境风险”产品目录。国家环保部与中国人民银行联合推进绿色信贷，与中国保监会联合推进环境污染责任保险，积极推进排污权有偿使用和交易试点工作。二是环境保护法规不断完善。相继出台了《规划环境影响评价条例》、《废弃电器电子产品回收处理管理条例》和《放射性物品运输安全监督管理条例》。三是环保科技标准进一步强化。发布我国首个《环境保护技术发展报告》，制定（修订）了140余项国家环保技术标准，国家环保标准目前已达1200项。涉及火电厂氮氧化物、重金属污染和农村污染防治的多项技术标准制定工作进展较大。四是规划工作取得积极成效。
完成了“十一五”环保规划执行情况中期评估。召开了“十二五”环保规划编制前期工作会议，在指导思想、基本原则、主要目标、重点工程和政策保障等方面形成规划的基本思路。
六、环评、环境监测和执法监察的力度加大。一是严把项目环评关。对简单低水平重复建设、“两高一资”和产能过剩项目不予批复或暂缓审批；有序推进规划环评。二是环境监测转型加快推进。发布《关于进一步加强新时期环境监测工作的意见》等；7月1日起，向社会发布100个国家地表水水质自动监测站的实时监测数据。三是深入开展环境执法检查活动。在高污染行业执法检查活动中，查处未批先建项目1824个，没有落实环保“三同时”项目3164个，依法责令停止建设或停产，限期落实整改措施；在环保专项行动中，各地出动242万多人次，检查企业98万多家，查处环境违法案件1万多件，挂牌督办2587件，119名责任人被追究责任；开展扩内需保增长建设项目专项检查、规模化畜禽养殖场执法检查等一系列专项检查。
七、环境保护宣传教育和国际合作工作积极推进。积极开展环境保护宣传，营造全社会关心支持和参与环境保护的良好氛围。环境保护在中美、中日、中哈高层对话中的地位日益突出，中俄环境保护合作互信互利、全面务实，中日韩、中国——东盟环保合作进入新阶段，与联合国环境署合作进一步深化，与阿拉伯、非洲国家合作进一步加强。